Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB3BPQ13352 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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ITGB3BPQ13352 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB3BPQ13352 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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