Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA3FQ13275 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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