Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SRSF5Q13243 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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SRSF5Q13243 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SRSF5Q13243 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SRSF5Q13243 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SRSF5Q13243 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRSF5Q13243 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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