Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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NR1H3Q13133 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR1H3Q13133 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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