Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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