Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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