Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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ECH1Q13011 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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