Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTP4A2Q12974 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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PTP4A2Q12974 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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