Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB40BQ12829 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB40BQ12829 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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RAB40BQ12829 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RAB40BQ12829 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RAB40BQ12829 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RAB40BQ12829 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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RAB40BQ12829 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB40BQ12829 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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