Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC173Q0VFZ6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms