Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EGR3Q06889 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms