Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP2BQ02880 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms