Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLOD1Q02809 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLOD1Q02809 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms