Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLCB3Q01970 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms