Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms