Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MDM2Q00987 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms