Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC5Q00444 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms