Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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FAM3AP98173 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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FAM3AP98173 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FAM3AP98173 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FAM3AP98173 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FAM3AP98173 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FAM3AP98173 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FAM3AP98173 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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