Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNB1P98172 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNB1P98172 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms