Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COG7P83436 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COG7P83436 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG7P83436 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COG7P83436 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms