Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASIC1P78348 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms