Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IP78347 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms