Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HBBP68871 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HBBP68871 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HBBP68871 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms