Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P63132 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms