Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERV-K104P61576 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms