Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB2AP61019 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms