Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP107P57740 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUP107P57740 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP107P57740 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms