Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX9P55771 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PAX9P55771 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PAX9P55771 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PAX9P55771 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms