Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIM2P55344 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIM2P55344 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIM2P55344 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIM2P55344 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIM2P55344 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIM2P55344 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIM2P55344 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms