Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP7P55210 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP7P55210 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP7P55210 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP7P55210 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP7P55210 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP7P55210 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms