Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA3P52797 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms