Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRE11P49959 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms