Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC1P48995 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms