Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP2K4P45985 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP2K4P45985 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms