Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP3P42574 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP3P42574 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms