Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPOP42166 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPOP42166 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPOP42166 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPOP42166 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPOP42166 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPOP42166 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPOP42166 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPOP42166 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPOP42166 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms