Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTR1BP42025 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTR1BP42025 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.9 ms