Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM3P40198 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms