Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HPCAL1P37235 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms