Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUP62P37198 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUP62P37198 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUP62P37198 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms