Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBP1P32455 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBP1P32455 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBP1P32455 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBP1P32455 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBP1P32455 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBP1P32455 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBP1P32455 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBP1P32455 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBP1P32455 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBP1P32455 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBP1P32455 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBP1P32455 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBP1P32455 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBP1P32455 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms