Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRS3P32247 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRS3P32247 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms