Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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