Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPIFP30405 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPIFP30405 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPIFP30405 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PPIFP30405 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPIFP30405 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPIFP30405 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPIFP30405 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PPIFP30405 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPIFP30405 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPIFP30405 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPIFP30405 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPIFP30405 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms