Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUSP1P28562 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms