Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms