Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTFRP26992 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms