Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
S100A1P23297 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
S100A1P23297 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms