Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms