Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms